非编码RNA (ncRNA) 通常不编码蛋白质，但在转录与转录后调控、表观遗传学调控等过程中发挥重要作用。当前有关非编码RNA结构解析和描述的数据库非常有限，研究人员对于非编码RNA如何介导各种相关的相互作用尚不了解，且对非编码RNA介导的相互作用组学研究不足。为了探讨以上问题，Genes 期刊于北京时间2月28日举办中国学术线上研讨会，并由黄涛研究员担任会议主席。研讨会特邀上海大学肖俊杰教授、深圳湾实验室周耀旗研究员和复旦大学杨力研究员担任主讲人，共同探讨基因领域的最新研究，欢迎从事非编码RNA领域的研究人员及学者积极参与交流。

 

 

研讨会信息

直播时间：2022年2月28日 (周一) 19:00-21:00

会议语言：中文

直播观看方式：

小鹅通：https://iwv.h5.xeknow.com/s/2EIBZS

BiliBili：http://live.bilibili.com/22429689

 

会议议程

 

19:00-19:05  黄涛 研究员

开场致辞

 

19:05-19:35  肖俊杰 教授

报告题目：非编码RNA在运动诱导生理性心肌肥厚中的作用

 

19:35-20:05  周耀旗 研究员

报告题目：RNA：永无止境的前沿

 

20:05-20:35  杨力 研究员

报告题目：环形RNA系统生物学研究

 

20:35-21:00

答疑环节

 

会议主席介绍

 

黄涛 研究员

中国科学院上海营养与健康研究所

 

中国科学院上海营养与健康研究所青年研究员，研究方向为生物医学大数据的机器学习和网络分析。曾在美国纽约西奈山伊坎医学院从事博士后研究。目前担任中国科学院青年创新促进会生命分会副会长。担任超过30份杂志的编委或客座编辑，主编了Methods in Molecular Biology 丛书的Computational Systems Biology-Methods and Protocols 和Precision Medicine 分册。发表论文100余篇，累计引用超过1万次，是大数据研究高被引学者，Elsevier 中国高被引学者，连续多年入选全球前2%顶尖科学家榜单。

 

主讲人介绍

 

肖俊杰 教授

上海大学

 

上海市曙光学者、上海市优秀学科带头人、宝钢优秀教师奖获得者、上海大学生命科学学院副院长、上海大学医学院副院长、上海器官修复工程技术研究中心主任、上海大学心血管研究所负责人、博士生导师。代表性论文发表在多本国际知名期刊上，并担任多本SCI期刊副主编/编委。国际心脏研究会中国分会秘书长、中国生物物理学会运动科学分会副会长、中国生理学会循环生理专业委员会委员等。主持国家重点研发计划、国家自然基金重点国际合作项目等。主要研究领域：运动保护心力衰竭的分子机制。

 

报告简介：从运动心脏中鉴别的靶点可以通过“一石三鸟”的效应保护心脏。肖教授及其团队通过对游泳训练小鼠左心室LncRNA芯片筛选结合荧光定量PCR检测发现LncRNA FR236703显著上调，将其命名为心脏生理性肥厚相关调控分子 (Cardiac Physiological hypertrophy associated regulator, CPhar)。过表达CPhar可促进心肌细胞肥大和增殖，抑制氧葡萄糖剥夺恢复所致的心肌细胞凋亡。动物水平研究表明，CPhar为运动介导心脏益处所必需，抑制CPhar表达，游泳训练的小鼠将不能发生生理性心肌肥厚；增加CPhar可以改善心肌缺血再灌注损伤所致的心室重构和心功能异常。机制研究发现，ATF7是CPhar发挥功能的关键下游分子。进一步采用质谱分析、RNA沉降、RNA结合蛋白免疫沉淀、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告实验及免疫共沉淀等方法揭示，CPhar通过结合RNA解旋酶DExD/H-box家族蛋白17 (DDX17)，特异性螯合生理性心肌肥厚关键转录因子C/EBPβ调控其下游分子ATF7。

 

周耀旗 研究员

深圳湾实验室

 

1984年学士毕业于中国科技大学近代化学系，1990年博士毕业于美国纽约州立石溪大学化学物理，1995-2000年哈佛大学诺贝尔奖获得者马丁·卡普拉斯组的博士后，2000年任纽约州立布法罗大学助理教授，2004年升为终身副教授，2006年成为印第安纳普度大学信息学院和医学院终身正教授，2013-2021年任澳大利亚格里菲斯大学糖组学研究所正教授。2021年起作为资深研究员全职加入广东省深圳湾实验室系统与物理生物学所。周教授长期致力于研究AI技术在蛋白质/RNA结构生物信息学方面的应用。周耀旗研究员目前的研究方向包括蛋白质/RNA结构及相互作用的预测和设计以及小分子、蛋白药的研究，分子检测仪器的开发。

 

报告简介：蛋白质早在1838年就被发现，但核酸直到1930年核酸才被发现，且20多年后研究者们才进一步认识到生命体合成蛋白质中的三种RNA (tRNA, rRNA, mRNA)。从那时起，每隔几年就有研究者会发现一种新类型的RNA，包括近期新发现的长非编码RNA、增强子RNA、circRNA和glycoRNA。这些新RNA的发现似乎永无止境，其根本原因是每个基因组都有一个巨大的功能未知非编码RNA库。例如，超过70%的人类基因组可以转录成RNA，但只有1.5%能进一步翻译成蛋白质。尽管有学者发现越来越多的非编码RNA在各种生命过程中发挥着关键作用并与许多疾病有关，但绝大多数仍处于未知状态。它们处于未知的原因是它们的序列保守性差，且学者们缺乏充足的结构信息来提供功能的线索。随着AlphaFold2在蛋白质结构预测上的重大成功，深度学习在RNA结构预测上会有面临什么样的挑战及带来什么样的惊喜？

 

杨力 研究员

复旦大学

 

长期从事针对基因组和转录组的计算生物学及相关碱基编辑前沿技术创新体系研究。近期，杨研究员构建了一系列高效计算生物学新体系，阐明环形RNA生成加工受互补序列调控新机制、绘制环形RNA可变反向剪接和可变剪接图谱、发现环形RNA通过其特殊二级结构与免疫因子互作参与先天免疫调控等；开展大数据整合分析，揭示RNA碱基编辑和修饰互作及机制，并利用核酸编辑酶创建多种高效基因组碱基编辑新体系。

 

报告简介：除了正常剪接将外显子序列连接形成成熟的线形RNA分子以外，在真核生物中还存在一种反向剪接反应，使得基因的外显子序列反向首尾连接形成环形RNA。杨研究员及其团队创建了包含预测外显子环形RNA流程 (CIRCexplorer) 等一系列新技术体系，首次证明了来自于内含子的互补序列所介导的环形RNA产生新机制，并揭示环形RNA和线形RNA竞争产生的序列基础；全面揭示环形RNA可变反向剪接和可变剪接的复杂性和多样性，表明环形RNA具有两种特殊的可变反向剪接类型和四种已知的通用可变剪接类型；系统地阐明环形RNA的可变反向剪接受到其上下游内含子互补配对序列的竞争配对调控机制；并进一步发现环形RNA在其它多个层次的调控机制。近期，杨研究员及其团队还构建了一系列基于CRISPR/Cas技术，且针对反向剪接位点的环形RNA敲低和敲除方法，为环形RNA的生成加工及功能研究提供了新手段和研究思路。

 

互动有奖

 

本次研讨会共设置5个获奖名额，获奖参与者均会收到定制礼包 (印有期刊logo的小米水杯和多功能双肩包)。

 

奖品设置：最佳邀请奖2名；最佳现场提问奖3名。

 

本次研讨会获奖名单将于3月7日公布于“MDPI开放数字出版”，欢迎大家踊跃参与，说不定获奖的就是你！

 

会议相关特刊推荐

 

Research on Non-coding RNA Structure and Function

Edited by Tao Huang, Lina Ma and Xianyang Fang

Submission Deadline:15 May 2022

https://www.mdpi.com/journal/genes/special_issues/Research_RNA

Genes 期刊介绍

 

主编：J. Peter W. Young, University of York, The United Kingdom

期刊主题涵盖了与DNA、RNA、染色体、基因、遗传学和多组学相关的所有内容。Genes 下设18个专栏，从人类、动物、植物、微生物、分子遗传、种群进化和高新技术等多个角度全方位审视遗传学和基因组学的前沿研究。

2020 Impact Factor：4.096

2020 CiteScore：4.4

Time to First Decision：17.4 Days

Time to Publication：36 Days

 

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