MDPI武汉汉口办公室成立于2013年，目前编辑出版生物、化学、数学、物理、材料、工程、计算机、信息科学、环境等多个学科领域的开放获取期刊。出版期刊150余本，其中SCIE期刊33本，具备较高国际影响力的学术期刊有IJMS、Polymers、Plants、Diagnostics、Biomedicines、Entropy、Fractal and Fractional、Microorganisms、Viruses、Pharmaceuticals、Aerospace、Micromachines、Minerals等。截至2025年底，有员工1500余人。

MDPI武汉光谷办公室成立于2021年，目前编辑出版生物、医药、材料、化学、环境、工程、农业、社科、能源等多个学科领域的开放获取期刊。其中有较高国际影响力的学术期刊有Metabolites、JFB、Membranes、Magnetochemistry、Reports、WEVJ、Future Transportation、Encyclopedia等，同时办公室有IJMS、Molecules、Sustainability、Sensors、Remote Sensing、Applied Sciences、JCM等期刊团队成员。截至2025年底，有员工630余人。