截至2025年年底，MDPI在全球范围内拥有超过8000名员工，主要分布于编辑部门（人员规模5400余人），制作部门（1500余人），市场部门（260余人），HR部门（180余人），IT部门（290余人），行政部门（140余人）和作者服务部门（150余人）等。

编辑部门作为负责期刊全流程编辑工作的核心业务单元。该部门下设出版人200余人，责任编辑400余人，栏目编辑及助理编辑共4000余人，共同保障学术出版工作的有序开展。

依托卓越的编辑与支持团队，MDPI通过规范透明的出版流程进一步强化质量保障。我们始终坚持严格、透明的同行评审制度，确保学术成果的权威性与评审过程的公正性。我们相信，同行评审对所有参与者而言都是高效、严谨且公平的。

大多数期刊采用单盲评审，至少两位独立审稿人评审，最终由主编或经主编授权的学术编辑决定录用或拒稿。MDPI期刊主编均为相关领域奠基人及领军人物，拥有丰富的研究与出版经验，在学术界享有盛誉。主编全面负责稿件的接收、学术质量把控，特刊（Special Issues）、主题（Topics）、专题集（Topical Collections）的选题审批，以及客座编辑（Guest Editors）、主题编辑（Topic Editors）、专题编辑（Collection Editors）的审批，并主导编委会任命，持续推动开放获取期刊的学术水平与期刊国际影响力。

为保障编辑工作的专业性及规范化，MDPI内部设有多个质量管控委员会，包括Editorial Processing Commiittee、Ethics Committee、Special Issue Committee和Website Committee等。此外，为适应编辑流程中的特定需求，进一步提升出版质量并实现工作的精细化与全面化，公司还专门设立了科研视觉设计团队（60余人）、图形摘要与视频摘要设计团队（10余人）以及校对团队（200余人）。